ปรกติ Storage Engine ของ MySQL ที่ให้ใช้บน hosting ทั่วๆไป
จะให้ใช้ InnoDB รึปล่าวครับ
ใช้ได้ครับ 
ยิ่งถ้า control panel เป็น plesk นี่รับรองว่าได้ชัวร์ เพราะ plesk ใช้ innodb ครับ
ขึ้นกับ my.cnf ของแต่ละโฮสที่ตั้งค่าไว้ครับ
หากต้องการใช้งาน ลองสอบถามทางโฮสดูก่อนเพื่อความแน่ใจ น่าจะดีที่สุด
เพราะระบบสำเร็จรูปต่างๆส่วนมากใช้ myisam ซะส่วนใหญ่